
拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康酸性反应绘制淀粉酶组学产品,实现1000+高妙度体现位点验出,可靠再次出现精品靶点,全周边所有地方生信讲解解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“看到”到“效验”全的流程功能,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。
PART 1
01、科学实验注意事项
02、测评数据源
03、经“点”重新
在试验动态数据中,查出多家参考文献中新闻报道的经典英文靶点举例说明衣康酸遮盖位点,如第1个被挖掘的衣康酸共价遮盖球淀粉酶KEAP1,更有糖酵解环路中的3个重要性点酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,已经炎性小体成分球淀粉酶NLRP3和上皮细胞病变全过程中的重要性点球淀粉酶RIPK3等,其质谱图有以下图图甲中。
04、商品作用
1.强有力的加密管控质控
商业运作化特喜欢的人测试探针孵育、SDS-PAGE判断、WB手机验证、子样本相关联性定量分析等一定要多方向位置位判断,为了保证楼盘结论可以信赖性。2.高效能质谱器材游戏平台
在Orbitrap Astral全新那代高粪便质谱仪带动下,完成衣康碱化修饰语位点及球蛋白检验新广度,促动科学有效分析新会发现。3.全程序一走式业务
由于拜谱生物工程建立完善的實驗渠道,可提供了“人体细胞培育→测试探针孵育→WB的检侧→举重若轻度衣康硝化作用突显的检侧→vip专享生信概述→对应位点PRM校验”全流程步骤的服务,省时省劲更好些。05、分折的内容(那部分)
06、技术应用走向
PART 2、论文说说
学术论文一
用英文怎么说主题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)
中文翻译子标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析
的研究内部:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。
(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)
文献资料二
英文版大标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)
中文翻译标题格式:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性
调查主要内容:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。
(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)
PART 3、例案并衍生要点
蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13兼具较少的底物搭配效率,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。
S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。
(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)
值得一提的是,在拜谱菌物衣康硝化作用表达组评测数据统计中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康过酸遮盖(下面图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。
PART 4、拜谱总结ppt
最为TCA再循环中的中央分泌物,衣康酸调接分泌、抗体细胞和症状之前的彼此做用,为治愈抗体细胞症状性症状提拱了混用治愈措施。衣康酸设备构造类型中的亲电性α,β-不达到饱和状态羧酸设备构造类型能对血清质上的吸附性半胱氨酸残基来烷基化呈现(迈克尔减伤症状),这样翻译英语后呈现被称之为“衣康酸呈现(itaconation)”,因此后果血清质用途,调整抗体细胞对答和分泌行业,为各种各样症状药物治疗研发团队提拱新方法。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化淡化淀粉酶组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物生物学完全酶联免疫法靶点基础代谢组(QMT1000)或热量分解靶向药物分解组类产品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!
规范医学文献
1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.