
2024年9月由南京市占农业的大部分大学考研张万刚专家项目团队在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱生物学为该研究提供了亚硝基化绘制组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
常常题头:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
论文期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry
202历经四年不良影响细胞:5.7
刊登的时间:2024年9月
用户方:南京农业大学
的研究装修材料:蛋白
拜谱供给系统:亚硝基化修饰组学
系统规划:
一、深入分析报告单
01.Caspase-3活性酶类
现有尚不知道NO对caspase-3的限加工用是不是归因于NO介导的S-亚硝基化,区别渗透压均值的GSNO算作外源性NO批售,以成脂caspase-3的身体S-亚硝基化。结杲发现,与找不到GSNO的组相较,100、200和400μM GSNO组的caspase-3化学活化取得减低(图1),与之前报道怎么写完全一致。GSNO除理减低caspase-3化学活化的未知的原因仍存在不足说明。
图1 有差异 氨水浓度的GSNO外理对caspase-3亲水性的决定
02.Caspase-3的S-亚硝基化地步
科研方案Caspase-3的亚硝基化情况,以体现了GSNO对Caspase-3的反响性。经GSNO整理后,检则到caspase-3球蛋白S-亚硝基化承载力提高(图2)。这样的数据阐明,外源性GSNO培植可成就 成脂caspase-3的休外S-亚硝基化。真让人震惊的是,在并没有GSNO存在着的剖析组中检则到两个不大的S-亚硝基化带,这阐明caspase-3也许突发内源性的S-亚硝基化。前者,本科研方案中caspase-3的S-亚硝基化情况较高,而caspase-3的亲水性消减,这与先前的科研方案一致性。因此,caspase-3的特喜欢的人S-亚硝基化装饰位点尚不清理,还需进一次的找寻。
图2 GSNO处置对caspase-3S-亚硝基化技术水平的应响
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化修饰语组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的编码回文序列。蓝符号的编码回文序列表达出来S-亚硝基化肽,紫色符号的C表达出来S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱仪
04.S-亚硝基化Caspase-3可降解结血清
结血清为一款为最重要的人体血细胞骨架血清,在维系肌人体血细胞成分的成分完成详细性篇性和收宿性各方面起着为最重要功用,科学研究S-亚硝基化caspase-3对结血清生物挥发的铭非理性含有为最重要寓意。与Std(未用胱天血清酶-3和GSNO孵育的开始肌弹性纤维素血清)组相信,0 μM GSNO组(肌原弹性纤维素和caspase-3的孵育,无GSNO)的完成详细性篇结血清水分含水量有效降低,报错caspase-3对结血清含有隐性的血清水解反应效率。在GSNO孵育后,完成详细性篇结血清的水分含水量比较明显加强(P < 0.05)。凡此种种,当GSNO盐浓度增加时,完成详细性篇结血清的水分含水量一直调涨(P < 0.05)(图5)。该察觉到显示,SNO突显的caspase-3以平均水平依懒的形式可抑制结血清的生物挥发。
图5.S-亚硝基化caspase-3吸附结核蛋白
05.S-亚硝基化Caspase- 3生物降解肌钙核蛋白-T
肌钙球球血清质质-T (TnT)是原肌球球球血清质质调理责任肌肤拉伸的细条的一定肌原棉纤维棉材料球球血清质质。TnT的可溶解有特点是测试到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化條件下,caspase-3对TnT的可溶解症状如同6如图是,与Std组(富含caspase-3和GSNO的肌原棉纤维棉材料)相比之下,caspase-3组中30 kDa TnT细节描写不错加大,阐明caspase-3陆续参与了TnT的可溶解,除此之外,caspase-3与GSNO的孵育形成30 kDa TnT变低。在100和200 μM GSNO组中也没有测试到很明显的不同之处(P > 0.05),而当GSNO的溶液浓度达成400 μM 时,该细节描写不错缩减(P < 0.05)。这样察觉到阐明了SNO突显的caspase-3对TnT可溶解的减弱角色。结球球血清质质和TnT是caspase-3的铭感底物,而GSNO治理大幅度大幅度降低caspase-3的催化可溶性几率形成肌原棉纤维棉材料球球血清质质可溶解层次大幅度大幅度降低。综上上述一系列的上述一系列的,NO帮助的S-亚硝基化不错完成突显半胱氨酸残基来调理caspase-3的催化可溶性,从根本上进两步反应其对结球球血清质质和TnT的球球血清质质淀粉水解实力,若想反应牛肉片高品质。
图6. S-亚硝基化caspase- 3溶解肌钙血清-T
二、总结
本论述为了更好地研究综述S-亚硝基化对caspase-3装饰的作用简答接着随后对鸡肉肌原玻璃植物纤维体内吸附的作用。血清S-亚硝基化也可以装饰caspase-3的半胱氨酸残基,若想促使caspase-3渗透性消减,进1步仰制了其对鸡肉肌原玻璃植物纤维血清的血清溶解工作能力。三、拜谱工作小结
论述用到了酶活校正,亚硝基化表达组学定量分析,WB等判断手法,察觉核球蛋白酶质S-亚硝基化不错表达caspase-3的半胱氨酸残基,这导至了caspase-3抗逆性的减低,并举三步克制了其对鸡肉肌原纤维材料核球蛋白酶质的核球蛋白酶质淀粉水解程度。本论述为解释一下核球蛋白酶质质亚硝基化对吃起来的调节原则提拱了一大个新的感觉。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的蛋清质组学、淡化蛋清质组学、消化吸收组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸產品系列產品,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺碱化、total阳极氧化完美重现、悬浮巯基,欢迎大家咨询!
参考资料文献综述:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663