
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物技术 为其提供 TMT蛋清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
探究可是
的研究人工洞察分析一下随保温用时变长鸡肉的硬性、持来说水力、色彩、游走铁分量、ROS、脂质过防氮化合物、MDA、GSH和GPX4水平面来测评力量聚集上皮人体细胞的铁致死的状态。结杲屏幕上显示,保温用时变长后,鸡肉的硬性在第六天和第6天有明显性急剧下降;持水技能减轻;色彩变深,有了亮泽,鲜橘大红色转成暗橘大红色。因此,游走铁、灵活性氧和MDA的分量有明显性增强,上皮人体细胞凋亡率有明显性上升。 探讨的人员分离出来多种冰箱時间的力量样板的淀粉酶质,接着去SDS-PAGE具体解析,淀粉酶质条带在多种時期分布区光滑且相近(图1a)。跟据淀粉酶在多种样板中的表明原因,具体解析找到一个时间组样板的中五位数贴近于一个时间水准(图1b),这说明力量样板淀粉酶质有着好的的组内相近性和组间区别性。 蛋清质组学共监定出1996种蛋清质。以B0为比对组,选择B1、B2、B4和B6中的蛋清做不同化表述方式具体深入分析,共监定到37几个DEPs。将火山图多维深入分析,并有不同 FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两人准则具体深入分析DEP。数据如下图所提示 1c-f所提示 ,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别监定出22、33、73和140个DEPs,在这当中分刘海别上浮6、11、32和85个,下降16、22、41和5二个。聚类算法的方法评估报告格式了有不同 冷藏箱时候健身肌肉进行进行中蛋清质的表述方式,数据提示 健身肌肉进行蛋清表述方式不同化随着时期推移放置时期的增高而增高(图1g)。
图1| 区别冷藏箱耗时的力量印刷品血清质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 各种不同保鲜冷库准确时间的身体肌肉试样地域差异球蛋白深入分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁死掉蛋白质肽的PRM酶联免疫法分析一下(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 研究背景KEGG聚集不同之处展示球蛋白的铁意外死亡系统(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱工作小结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生态学提供了TMT降钙素原检测球核苷酸组学技術安全服务培训,拜谱生物制品已设备开发搞定并创立了改善较为成熟的转录组学、球血清组学、排泄组学并且几组学协同设备技術安全服务培训采集体系,欢迎致电咨询!
关联性医学文献:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.